在日前落幕的2021年國(guó)際遺傳工程機(jī)器大賽(International Genetically Engineered Machine Competition,iGEM)中,由西交利物浦大學(xué)七位本科生組成的代表隊(duì)從在全球343支參賽隊(duì)中脫穎而出,斬獲金獎(jiǎng)。自2015年首次參加該項(xiàng)賽事以來(lái),西浦本科生團(tuán)隊(duì)已累計(jì)獲得三次金獎(jiǎng)牌、三次銀獎(jiǎng)牌。
iGEM是全球合成生物學(xué)領(lǐng)域的頂級(jí)賽事。今年的西浦獲獎(jiǎng)團(tuán)隊(duì)由生物科學(xué)、生物信息學(xué)、機(jī)械電子工程專業(yè)的學(xué)生組成,跨學(xué)科研究小組,從跨學(xué)科的角度提出了對(duì)定量檢測(cè)食品中細(xì)菌的方法,并對(duì)其原理進(jìn)行了充分驗(yàn)證。西浦慧湖藥學(xué)院的韓國(guó)霞博士、理學(xué)院的孟佳博士以及實(shí)驗(yàn)室老師們?cè)诨A(chǔ)知識(shí)和實(shí)驗(yàn)技能方面為團(tuán)隊(duì)提供了支持。
(前排從左到右:聶欣辰、劉煒琳 、楊翊偉;后排從左到右:韓國(guó)霞博士、王思淼、韓欣研、陳力哲、楊書淮)
團(tuán)隊(duì)成員陳力哲介紹道,“iGEM要求我們完整的使用工程化手段,通過(guò)設(shè)計(jì)構(gòu)建測(cè)試到實(shí)驗(yàn)反饋的多次迭代,設(shè)計(jì)和創(chuàng)造出功能性的生物系統(tǒng)要求我們從設(shè)計(jì)、構(gòu)建、測(cè)試到實(shí)驗(yàn)反饋,完整地使用工程化的手段去設(shè)計(jì)和創(chuàng)造出新的生物系統(tǒng)。在今年的比賽中,我們從解決實(shí)際問(wèn)題出發(fā)尋找合適的生物工具,在計(jì)算機(jī)建模的基礎(chǔ)上進(jìn)行生物實(shí)驗(yàn)?!?/p>
“當(dāng)時(shí)選擇題目的時(shí)候,剛好看到一則關(guān)于食品安全的新聞,人們?cè)谑秤昧艘环N名為‘酸湯子’的小吃后導(dǎo)致食物中毒。同時(shí)我們發(fā)現(xiàn)在社交媒體上,食品安全是十分受關(guān)注的內(nèi)容?!标?duì)長(zhǎng)韓欣研說(shuō),“我們希望借助這個(gè)科研項(xiàng)目,更好地了解食源性疾病以及導(dǎo)致疾病的細(xì)菌類型,對(duì)現(xiàn)有的常用檢測(cè)手段和還沒(méi)有被關(guān)注到的問(wèn)題進(jìn)行查漏補(bǔ)缺?!?/p>
小組成員使用噬菌體作為檢測(cè)探針,無(wú)細(xì)胞系統(tǒng)作為半定量信號(hào)發(fā)生系統(tǒng),用熒光強(qiáng)度表示細(xì)菌數(shù)量的范圍,來(lái)檢測(cè)食物中的細(xì)菌數(shù)量是否超出國(guó)家標(biāo)準(zhǔn)的半定量信號(hào)。
團(tuán)隊(duì)成員楊書淮解釋道,目前市場(chǎng)上使用的食品檢測(cè)方式存在檢測(cè)時(shí)間過(guò)長(zhǎng)的問(wèn)題?!耙酝臋z測(cè)手段是通過(guò)細(xì)胞增殖來(lái)進(jìn)行信號(hào)放大進(jìn)而達(dá)到定量細(xì)菌的目的,周期較長(zhǎng);而我們依靠無(wú)細(xì)胞系統(tǒng)進(jìn)行細(xì)菌定量信號(hào)擴(kuò)增,只需要2-3個(gè)小時(shí)便可以觀測(cè)到表示細(xì)菌數(shù)量范圍的半定量信號(hào),即使加入上游的噬菌體識(shí)別和裂解細(xì)菌的時(shí)間,整套系統(tǒng)也能在6-7小時(shí)內(nèi)完成細(xì)菌定量檢測(cè)整個(gè)檢測(cè),較好的時(shí)效性可以作為一種初步篩查的手段?!?/p>
“此外,以往的檢測(cè)手段需要人為判斷細(xì)菌量是否超過(guò)閾闕值,而我們的系統(tǒng)可以將超過(guò)閾值闕值和沒(méi)有超過(guò)閾值闕值的細(xì)菌量轉(zhuǎn)化為特定的兩種信號(hào)(有或沒(méi)有熒光)來(lái)輸出檢測(cè)結(jié)果,省去了人為判斷的過(guò)程?!彼f(shuō)。
在參賽項(xiàng)目中負(fù)責(zé)社會(huì)實(shí)踐部分的楊翊偉談到,食品安全不僅是市場(chǎng)監(jiān)管部門關(guān)注的問(wèn)題,大眾也需要清楚了解食品安全的重要性?!拔覀兠嫦虼蟊婇_(kāi)展了一系列科普教育活動(dòng),在蘇州青少年科技博物館、翰林小學(xué)舉辦科普講座,普及食源性疾病的知識(shí)?!?/p>
受疫情影響,團(tuán)隊(duì)成員在研究過(guò)程中也遇到了意想不到的挑戰(zhàn),特別是從海外渠道購(gòu)買的實(shí)驗(yàn)材料無(wú)法按時(shí)到達(dá),影響了已經(jīng)規(guī)劃好的實(shí)驗(yàn)計(jì)劃。
“一方面,我們對(duì)方案進(jìn)行調(diào)整,把部分實(shí)驗(yàn)換成計(jì)算機(jī)建模的方式;同一時(shí)間也在國(guó)內(nèi)尋找可替代材料,推動(dòng)重要的實(shí)驗(yàn)進(jìn)程。”隊(duì)長(zhǎng)韓欣研說(shuō)。
“在比賽過(guò)程,我們了解到,需要不斷和外界交流,去調(diào)查真實(shí)存在的社會(huì)問(wèn)題,收集反饋并對(duì)實(shí)驗(yàn)進(jìn)行迭代,而不是閉門造車。通過(guò)自主發(fā)現(xiàn)問(wèn)題、解決問(wèn)題,我們能完善思考問(wèn)題的方式,提升靈活解決問(wèn)題的能力?!表n欣研總結(jié)道。(記者:王璐謠 編輯:石露蕓 圖片提供:劉煒琳)
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