首都醫(yī)科大學建校于1960年，是北京市重點高等院校，是北京市政府、國家衛(wèi)生健康委員會、教育部共建院校。已故著名泌尿外科專家、兩院院士、全國人大常委會副委員長吳階平教授為首任校長。現任黨委書記為呼文亮研究員，校長為我國著名分子神經生物學家饒毅教授。

      學校校本部設有11個學院、1個研究中心和1所附屬衛(wèi)生學校，包括基礎醫(yī)學院、藥學院、公共衛(wèi)生學院、護理學院、生物醫(yī)學工程學院、中醫(yī)藥學院、醫(yī)學人文學院、全科醫(yī)學與繼續(xù)教育學院、馬克思主義學院、國際學院、燕京醫(yī)學院，腦重大疾病研究中心，附屬衛(wèi)生學校。學校現有21所臨床醫(yī)學院（其中19所為附屬醫(yī)院），包括首都醫(yī)科大學宣武醫(yī)院（第一臨床醫(yī)學院）、附屬北京友誼醫(yī)院（第二臨床醫(yī)學院）、附屬北京朝陽醫(yī)院（第三臨床醫(yī)學院）、附屬北京同仁醫(yī)院（第四臨床醫(yī)學院）、附屬北京天壇醫(yī)院（第五臨床醫(yī)學院）、附屬北京安貞醫(yī)院（第六臨床醫(yī)學院）、附屬復興醫(yī)院（第八臨床醫(yī)學院）、附屬北京佑安醫(yī)院（第九臨床醫(yī)學院）、附屬北京胸科醫(yī)院（第十臨床醫(yī)學院）、首都醫(yī)科大學三博腦科醫(yī)院（第十一臨床醫(yī)學院）、附屬北京地壇醫(yī)院（第十二臨床醫(yī)學院）、附屬北京兒童醫(yī)院（兒科醫(yī)學院）、附屬北京口腔醫(yī)院（口腔醫(yī)學院）、附屬北京安定醫(yī)院（精神衛(wèi)生學院）、附屬北京婦產醫(yī)院（婦產醫(yī)學院）、附屬北京中醫(yī)醫(yī)院（中醫(yī)藥臨床醫(yī)學院）、附屬北京世紀壇醫(yī)院（腫瘤醫(yī)學院）、附屬北京康復醫(yī)院（北京康復醫(yī)學院）、附屬北京潞河醫(yī)院（潞河臨床醫(yī)學院）、中國康復研究中心（康復醫(yī)學院）、中日友好醫(yī)院（中日友好臨床醫(yī)學院），以及預防醫(yī)學教學基地（北京市疾病預防控制中心）。學校還設有39個臨床專科學院、?？茖W系，35個臨床診療與研究中心。

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