由于馬鈞掌握了軍事原理，因而他在軍事上兵器制造方面也有不少發(fā)明創(chuàng)造。從歷史文獻當中可以證明，他在兵器學方面的精深研究，足以和同時代的軍事學家諸葛亮相比。

那時候，魏國和蜀國經常打仗。蜀國大軍事家諸葛亮在出師北伐時，曾發(fā)明了一種可以把箭接連發(fā)射出去的連發(fā)射遠器--連弩。它每次可發(fā)數(shù)十箭，威力很大。魏軍在戰(zhàn)場上揀到，頗感驚奇。當時已經年老的馬鈞看到連弩后，認為這種兵器很好，說："巧是很巧了，但還有不到的地方，如再改進一下，威力還可增加五倍。"于是，他便將連弩進行了改進，果然效果甚佳。功效可提高五倍。

三國時官渡之戰(zhàn)，曹操曾使用“發(fā)石車”攻擊袁紹的陣地，但只能單發(fā)，效率不高。馬鈞擔心敵方在城樓上掛起濕牛皮，就能擋住發(fā)石車拋出的石頭。馬鈞在原來作戰(zhàn)用的發(fā)石車的基礎上，重新設計出了一種新式的攻城武器——輪轉式發(fā)石車。原來的發(fā)石車，象個大天平，一頭掛著一個斗，斗里裝滿大小石頭，另一頭掛著許多根繩子，作戰(zhàn)時，兵士們一齊用力拉繩子這頭，裝石頭那頭就飛快地翹起來，這樣，石頭就被拋出去打擊敵人。這種發(fā)石車缺點很多，每發(fā)射一次，都要花費一些時間，而且效果不大。馬鈞設計的新式輪轉式發(fā)石車，則克服了這些缺點。它是利用一個木輪子，把石頭掛在木輪上，這樣，裝上機械帶動輪子飛快地轉動，就可以把大石頭接連不斷地發(fā)射出去，使敵方來不及防御。馬鈞曾用車輪子來做試驗，可以連續(xù)把幾十塊磚瓦射出幾百步遠（一步約合1.45米），這在當時說來，威力是相當大的。

然而，這種設計卻遭到地圖學家裴秀的譏笑和發(fā)難，但得到文學家傅玄的理解和支持。傅玄對安鄉(xiāng)侯曹羲說，馬先生要制造的是國家之精器、軍隊之要用，只要費一點木材，用兩個人，就能制造，不妨試驗一下，免得埋沒有用的東西。曹羲接受了這個建議，并把情況轉告給武安侯曹爽。但曹爽未予理睬。對此，傅玄感慨地說，試驗一下，本來是極易辦到的事，馬先生是有名的巧人，尚且不受重視，何況那些懷才的無名之輩呢？

馬鈞善于巧思，注重實踐，對技術問題有自信心，但不擅長辭令。

馬鈞在手工業(yè)、農業(yè)、軍事等方面有很多發(fā)明創(chuàng)造，是三國時代最優(yōu)秀的機械制造家，就是在中國古代幾千年的歷史當中，也不多見，堪稱一代機械大師，當時，有位叫傅玄的文學家曾稱贊他說："馬先生，天下之名巧也。"但由于封建統(tǒng)治階級腐敗沒落，馬鉤的許多發(fā)明創(chuàng)造沒有得到重視。他的一生，從少年到老年，一直不得志，雖然他曾作過給事中官，但他的工作仍然受到阻撓和蔑視，技巧一直未得到順利發(fā)展的機會。盡管文學家傅玄曾幾次在魏國貴族安鄉(xiāng)侯曹義、武安侯曹爽那里推薦他，也還是沒有受到重視。傅玄對此感慨頗深地說："馬先生的巧，雖古時的公輸般（魯班）、墨翟，以及近代的張衡，也比不過，但公輸般和墨翟都能見用于時，張衡和馬鈞的一生卻不能發(fā)揮其長，真是最可痛心的事。"傅玄的話道出了在封建社會里多少發(fā)明家被埋沒了的事實。

馬鈞對人類的貢獻，雖然沒有被封建貴族所重視，但他的發(fā)明創(chuàng)造卻得到了廣大勞動人民的歡迎，幾千年來，他的功績和美名一直被勞動人民所傳頌。