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朱元璋在擊敗陳友諒、張士誠、方國珍等其它南方起義軍和南方大元勢力后，于1367年開始北伐，在大將徐達、常遇春等的協(xié)助下，于1368年八月攻克通州，元惠宗于七月二十八日，倉惶北逃，徐達率軍攻陷元朝的首都元大都(北京)，元作為一個全國性質(zhì)的統(tǒng)治結(jié)束。

統(tǒng)治中原近百年的元朝覆滅后，元順帝這個亡國之君既未戰(zhàn)死，也沒有自縊，而是帶著殘余部眾一同撤回了蒙古高原，這個曾經(jīng)讓蒙古祖先興起的故地。元朝作為外來政權(quán)，其統(tǒng)治者竟能在亡國之際全身而退，不得不說是一個奇跡。

元朝的覆滅對于蒙古人來說，只是丟失了一部分中國領土，龐大的蒙古帝國依舊屹立在北方草原上。

元朝皇室得以創(chuàng)造全身而退的奇跡，與成吉思汗當年的瘋狂擴張，有著密不可分的關系。妥歡帖睦爾既是元朝的皇帝，也是蒙古的大汗，他對蒙古各部及各汗國享有絕對的宗主權(quán)。元順帝受中原文化的影響頗深，北歸對他的打擊是巨大的。雖然，他依舊是帝國的大汗，但卻時刻飽受“去國懷鄉(xiāng)”之痛。加之，明朝軍隊的追擊，元順帝更是終日惴惴不安。

1370年的5月，妥歡帖睦爾在沙拉木倫河河畔郁郁而終。元順帝死后，其子愛猷識里達臘繼承了衣缽，殘元政權(quán)又維續(xù)了八年。即位之初，這位新殘元皇帝還意氣風發(fā)，誓要重登皇位。但現(xiàn)實卻給了他重擊。到了1373年，明廷派出徐達攻打哈拉和林，要知道，哈拉和林可是黃金家族榮耀的象征，一旦被明軍攻破，蒙古帝國也將隨之消失。

正是因為其重要性，徐達所率領的部隊遭到了蒙古人的頑強抵抗。但是，徐達攻勢洶涌，他逼得愛猷識里達臘幾近絕望邊緣。后來，明軍因戰(zhàn)線太長，止步于土拉河畔。幾年之后，愛猷識里達臘抱憾離世，其子脫古思繼承了皇位。作為殘元第三任皇帝，脫古思統(tǒng)管的區(qū)域已縮至蒙古帝國的最初規(guī)模，恢復帝國昔日的榮光，顯得更加遙遙無期了。

到了1388年，明朝派出了十萬大軍攻打殘元，七萬部眾被俘，新皇脫古思逃走后被部下勒死。經(jīng)此一戰(zhàn)，殘元政權(quán)光環(huán)不再，眾多蒙古部落脫離其自立。到了1399年，貴力赤殺死了最后的大汗額勒伯克，殘元最后一任皇帝覆滅。

至此，延續(xù)三十年之久的殘元政權(quán)被滅，蒙古再次進入部落紛爭的階段。

殘元政權(quán)的覆滅，使得明朝失去了一位政敵。彼時的蒙古已成為“邊患”了，而非前朝殘余勢力。所以，在貴力赤奪取霸權(quán)之后，永樂皇帝朱棣并未責難他，反而表示了友好，并承認其對蒙古各部的宗主權(quán)。

1400年，貴力赤被阿蘇特部首領阿魯臺及衛(wèi)拉特部首領馬哈木聯(lián)合打敗。馬哈木及阿魯臺希望部族能夠在獨立于蒙古人之外的情況下獲得承認，而非做蒙古帝國的大汗，所以，他們在打敗貴力赤后，直接向明廷效忠，表明自己的部族是不會爭奪大汗之位的。

這樣的臣服深得明廷贊賞，于是，明朝廷便給了他們極大的統(tǒng)治支持。因為有明廷做后盾，衛(wèi)拉特部的霸權(quán)一度擴張至整個西蒙古地區(qū)。但是，這兩個部落的統(tǒng)治并不長久，因為，貴力赤之子額色庫再次崛起。他向阿魯臺及馬哈木發(fā)起了挑戰(zhàn)，誓要爭奪大汗之位。

經(jīng)過十多年的戰(zhàn)爭后，額色庫病逝。并在額色庫爭奪宗主權(quán)之際，額勒伯克之子本雅失里復辟了汗位。作為黃金家族的后裔，本雅失里顯然更具號召力。不久之后，阿魯臺等蒙古各部便站在了本雅失里這邊。

明朝怎會允許殘元政權(quán)復辟，在收到消息后，永樂皇帝立即親率大軍攻入蒙古。1410年至1411年間，明軍擊潰了阿魯臺軍隊。此戰(zhàn)之后，本雅失里失去了權(quán)威。1412年，馬哈木率領衛(wèi)拉特部眾打敗了這位正統(tǒng)的代表者，趁機奪得了汗位。

登臨大汗之位后，馬哈木直接與明朝斷交，永樂皇帝不得不再次攻打蒙古。彼時馬哈木所率軍隊，雖對明軍造成了嚴重打擊，但是，他為了保留實力，直接撤退至土拉河以西。因為，未能阻止明軍進入蒙古草原，馬哈木威望大不如前了。

大汗寶座再次懸空后，興安嶺東部的科爾沁部，在首領阿臺的帶領下奪取了蒙古中東部。

此時，阿蘇特部首領阿魯臺再次見風使舵，支持阿臺殺掉了本雅失里，擁戴其坐上了大汗寶座。科爾沁部也屬“黃金家族”的后裔，所以，永樂皇帝雖無法忍受衛(wèi)拉特部的叛變，但是，為了消滅“黃金家族”，他還是選擇了支持衛(wèi)拉特部。永樂皇帝為了消滅“黃金家族”而扶持衛(wèi)拉特部的政策，在其死后產(chǎn)生了作用。

1434年到1438年間，馬哈木之子率領衛(wèi)拉特部眾殺死了大汗阿臺及阿魯臺。大汗之位再次懸空，此時，本雅失里的兄弟阿占被擁戴為大汗。若是深究便會發(fā)現(xiàn)，此時的蒙古帝國已從“黃金家族”轉(zhuǎn)入“綽羅斯家族”手中?！包S金家族”已然完結(jié)，明朝皇帝放過了這位新君王。但讓明廷沒想到的是，衛(wèi)拉特部雖沒有顯赫的歷史背景，但他們依舊心懷光復帝國榮耀的野心。

衛(wèi)拉特人極為精明，他們并未向當時國力強勁的明朝宣戰(zhàn)，而是轉(zhuǎn)而將刀鋒對準了察合臺汗國。彼時尚未登臨可汗之位的額森打敗了衛(wèi)思汗，并強娶了哈尼木公主。因為，衛(wèi)思汗擁有黃金家族血統(tǒng)，所以，衛(wèi)拉特部與之聯(lián)姻后，便擁有了強大的號召力。等到額森繼承汗位時，蒙古帝國疆域已擴張至長城地區(qū)，從前象征正統(tǒng)的哈拉和林也被其收入囊中。

1499年，明廷悔婚，怒不可遏的額森隨即率軍蹂躪了彼時尚處中國邊陲的山西等地，明廷派出王振迎敵。雙方交戰(zhàn)后，額森殲滅明軍數(shù)十萬人，連皇帝都被其擄走，這就是歷史上的“土木堡之變”。但是，因衛(wèi)拉特人始終難以攻入宣化和大同，額森便率部眾退回了蒙古。幾個月之后，額森再次率兵攻打北京，但此時，他遇到了勁敵于謙，“北京保衛(wèi)戰(zhàn)”就此打響。

額森數(shù)次進攻均被其打退，后來，明朝援軍趕到，因為兵力懸殊，額森只好倉皇撤退。1453年，額森與明廷議和，宣布臣服于明朝。此舉表明額森已放棄了帝國的宗主權(quán)，消息傳開后，蒙古各部隨即宣布獨立。1455年，額森被殺，其子阿馬桑赤臺吉繼承了汗位。但是，在其攻入察合臺汗國后，衛(wèi)思汗之妹及其子在后方制造混亂，極大的削減了衛(wèi)拉特人的實力。

在衛(wèi)拉特部的實力被削減時，成吉思汗后裔卻并未立刻反攻，彼時，他們正為了爭權(quán)奪利而互相殘殺。1467年，滿都古勒大汗在討伐侄孫的戰(zhàn)爭中去世，而博勒呼濟農(nóng)作為繼承人，也在繼承汗位之前被暗殺。至此，昔日興旺的黃金家族僅剩一個小男孩，他就是繼承人之子達延。

經(jīng)歷過慘烈家族內(nèi)訌的達延，孤苦無依，是滿都古勒汗的遺孀撫養(yǎng)了他。她一直保護著這個孩子，并在1470年宣布其為大汗。滿都海賽音還是個巾幗不讓須眉的女子，她率軍擊敗衛(wèi)拉特人，為達延日后的統(tǒng)治奠定了基礎。

達延統(tǒng)治蒙古帝國長達七十三年，在其1481年親政之后，達延率軍平定了土默特人及兀良哈人發(fā)起的叛亂。1479年至1505年，達延又帶領部眾騷擾了明朝邊境，阻斷了明廷與衛(wèi)拉特人的聯(lián)系。1543年，達延可汗去世，其孫博迪繼承了汗位。

達延的統(tǒng)治雖然確保了汗位的穩(wěn)定傳承，但卻并未解決蒙古族瓜分遺產(chǎn)的問題。在大汗死后，帝國便形成了由家庭成員組成的聯(lián)邦式國家。內(nèi)部各級首領均為兄弟或堂兄弟，他們雖認可察哈爾部的權(quán)力，但是，卻始終處于獨立狀態(tài)。

隨著時間的推進，所謂的大汗繼承者，逐漸失去了統(tǒng)治整個帝國的能力，衛(wèi)拉特人及通古斯人都成為了其勁敵。但是，彼時的衛(wèi)拉特人正與哈薩克汗國、綽羅斯家族酣戰(zhàn)，只有通古斯人有能力結(jié)束蒙古帝國的歷史。

1604年，林丹承襲汗位。

林丹汗并非昏庸之輩，他早已知曉后金對蒙古的野心。因此，從剛繼位開始，林丹汗便開始統(tǒng)一各部。1627年，林丹汗派兵收服了右翼鄂爾多斯、土默特等部，聲威由此大振。

次年，喀喇沁、朵顏兀良哈及土默特等部聯(lián)合十萬大軍迎擊林丹汗，召城一戰(zhàn)后，林丹汗損耗了四萬兵力。其實，這一戰(zhàn)，林丹汗注定會失敗，因為，他的敵人是結(jié)合漢人謀略與蒙古人彪悍的后金帝王努爾哈赤及皇太極。

努爾哈赤統(tǒng)治時期，科爾沁及扎魯特部均通過聯(lián)姻歸順于后金。而土默特、兀良哈及喀喇沁等部因害怕林丹汗報復，便也歸順了后金。1625年，林丹汗出兵科爾沁，后金則派兵增援了科爾沁，隨后，林丹汗被迫撤退。繼位后的皇太極，將火力對準了林丹汗。

1628年，他派出阿濟格同喀喇沁部會盟，共擊林丹汗。此時的林丹汗，早已陷入孤立無援的困境，他被迫撤退至歸化城留守。1632年，皇太極率兵西征，他同蒙古各部一起攻打林丹汗。面對來勢洶洶的圍攻，林丹汗被迫驅(qū)趕十萬人畜渡黃河西逃。

看到林丹汗大勢已去，其部眾大多在途中散去。

林丹汗逃至青海兩年后，便在打草灘郁郁而終。

蒙古帝國與明帝國對峙了兩百多年，誰都未能擁有壓倒性優(yōu)勢。但在前后不過十年的時間內(nèi)，這兩個帝國卻都被滿清所滅。1635年，多爾袞招降林丹汗部眾，其妻交出可汗印信。至此，漠南蒙古被歸入后金版圖，昔日群雄爭搶的大汗之位就此斷絕，蒙古帝國就這樣消失了。

最后，我們再說明一下“黃金家族”，廣義上指成吉思汗的后人是黃金家族。元朝建立后狹義上黃金家族指，托雷甚至忽必烈一系后裔，成吉思汗的其他后代都不能算。元末留在中原部分的黃金家族融入漢族。逃至漠北部分的黃金家族至瓦剌也先時“凡故元頭目苗裔無不見殺?！?/p>

達延汗改制后黃金家族僅限于達延汗子孫，蒙古察哈爾部大汗王廷嫡系獨享。元末之時，部分融入漢族。明末之時，皇太極擊敗林丹汗后，滿清貴族收取林丹汗八大福晉，至此，部分黃金家族融入到了后金的宗室之中。民末之時，民族識別部分黃金家族融入到了漢族。

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