商鞅變法的弊端是：1、以農耕為主、壓制工商業(yè)發(fā)展的變法舉措導致整個民族的民主意識弱化；2、“編民為什伍”和“連坐”法，使人民互相監(jiān)視、互相告發(fā)，從而使全體人民時刻處在互相猜疑的恐怖之中。

重農抑商政策。商鞅獎勵耕織的政策固然沒錯，但他又規(guī)定凡從事末業(yè)（工商）者，全家沒入官府，罰為官奴婢。這種重農抑商政策政策以后被歷代封建統(tǒng)治者奉為金科玉律，即時在封建社會早期已無多少積極作用，到我國封建社會后期更是成為嚴重阻礙工商業(yè)發(fā)展的政策。

“編民為什伍”和“連坐”法：商鞅為了加強管理和統(tǒng)治廣大居民，規(guī)定分五家為一伍，兩伍為什。又規(guī)定什、伍之內各家互相糾察，“不告奸者腰斬，告奸者與斬敵首同賞，匿奸者與降敵同罰?！边@種使人民互相監(jiān)視、互相告發(fā)，從而使全體人民時刻處在互相猜疑的白色恐怖之中，到王安石變法時演變?yōu)椤氨＜字贫取保院笥直粐顸h所繼承。到抗日戰(zhàn)爭時期，淪陷區(qū)的日本侵略者也實行保甲制度。

商鞅自魏國入秦，并提出了廢井田、重農桑、獎軍功、實行統(tǒng)一度量和建立縣制等一整套變法求新的發(fā)展策略，深得秦孝公的信任。于是，便任他為左庶長，在公元前356年和公元前350年，先后兩次實行以“廢井田、開阡陌，實行縣制，獎勵耕織和戰(zhàn)斗，實行連坐之法”為主要內容的變法。