民航局直屬高校共有4所，分別為中國民航大學、中國民用航空飛行學院、上海民航職業(yè)技術學院、廣州民航職業(yè)技術學院。

中國民航大學簡介：

中國民航大學（Civil Aviation University of China）是中國民用航空局直屬的一所以培養(yǎng)民航高級工程技術和管理人才為主的高等學府，是中國民用航空局、天津市人民政府、教育部共建高校，是教育部第二批“卓越工程師教育培養(yǎng)計劃”高校、天津市高水平特色大學建設高校，首批入選國家級大學生創(chuàng)新創(chuàng)業(yè)訓練計劃、國家級新工科研究與實踐項目，國際航空認證委員會教育會員，國際民航組織升級版航空培訓計劃正式會員，CDIO工程教育聯(lián)盟成員單位，具有推薦優(yōu)秀應屆本科畢業(yè)生免試攻讀研究生資格高校。

中國民航大學前身是1951年9月成立的軍委民航局第二民用航空學校，1956年更名為中國人民解放軍第十四航校，1958年更名為中國民用航空高級航空學校，1963年重組為中國民用航空機械?？茖W校，1977年更名為中國民用航空?？茖W校，1981年更名為中國民用航空學院，2006年5月30日，更名為中國民航大學。

中國民用航空飛行學院簡介：

中國民用航空飛行學院簡稱中飛院（CAFUC），位于四川省廣漢市，是中央部屬高校，由中國民用航空局直屬，入選聯(lián)合國重點推廣的“MPL”課程試點單位、四川省“雙一流”建設計劃。是全球辦學規(guī)模最大的飛行培訓機構，是世界上規(guī)模最大的以飛行訓練為主的學校，建校以來，中飛院已為中國民航培養(yǎng)了70%的飛行員、80%的機長、90%的功勛飛行員和100%的特級飛行員，被譽為中國民航飛行員的“搖籃”、中國民航管理干部的“黃埔”。

前身是創(chuàng)建于1956年的中國民用航空局航空學校，同年9月，更名為中國人民解放軍第十四航空學校，后又以中國民用航空高級航校、中國民用航空飛行?？茖W校為校名。1987年11月，升格為本科院校，更名為中國民用航空飛行學院。