三公和九卿以及列卿等，都各有自己的府寺，以處理日常事務(wù)。大事總匯于丞相，或最后請皇帝裁決。由皇帝任免，不得世襲；分工明確，行政效率高；丞相位高權(quán)重；新的較完備的官僚制度。

秦始皇設(shè)立三公九卿制度，為封建專制主義中央集權(quán)國家制度的建立創(chuàng)造了雛形，對以后的歷代封建王朝的建立，有著重要的影響。

三公九卿制度的基本結(jié)構(gòu)從秦朝一直沿用到兩晉，直至隋文帝創(chuàng)三省六部制。從三省六部制的結(jié)構(gòu)上來看，也無處不有著三公九卿制結(jié)構(gòu)的影子。此后，一直到明代，明太祖朱元璋廢掉中書省、尚書省及門下省，六部直接對皇帝負(fù)責(zé)，中國古代歷史中的中央官制三級制度才算壽終正寢。三公九卿這一制度沿用約達(dá)800年，并從結(jié)構(gòu)上影響三省六部制，并左右中國古代中央官制約達(dá)700年?？梢哉f，三公九卿制，上承夏商周，下接隋唐宋元，在中國歷史上留下了濃重的一筆。

三公九卿制度雖在結(jié)構(gòu)上沿用了近700年，但在其間，官職的名稱及權(quán)利和三公九卿制的部分結(jié)構(gòu)卻一直在變動(dòng)之中。并且，制度之外其他中央機(jī)構(gòu)的出現(xiàn)也沖擊了三公九卿制。