中科院和工程院的區(qū)別在于工作性質(zhì)上的不同。中科院院士為代表的高級科學人才，是在科學技術領域作出系統(tǒng)的、創(chuàng)造性成就的者。而以工程院院士為代表的高級技術人才，是在工程技術方面作出重大的、創(chuàng)造性成就和貢獻的專家。

機構(gòu)性質(zhì)不同：

中國科學院為中國自然科學最高學術機構(gòu)、科學技術最高咨詢機構(gòu)、自然科學與高技術綜合研究發(fā)展中心。是國家在科學技術方面的最高咨詢機構(gòu)。負責對國家科學技術發(fā)展規(guī)劃、計劃和重大科學技術決策提供咨詢。

中國工程院是中國工程技術界最高榮譽性、咨詢性學術機構(gòu)，國務院直屬事業(yè)單位。具有很高的工程科學技術水平和在國際上享有良好聲譽，對中國工程科學技術事業(yè)發(fā)展做出貢獻或在促進我國工程科學技術界國際交往方面有重要作用的外國籍專家、可被提名并當選為中國工程院外籍院士。

科學成就不同：

中國科學院提出了建設國家創(chuàng)新體系的構(gòu)想，先后實施知識創(chuàng)新工程、“創(chuàng)新２０２０”、《“率先行動”計劃暨全面深化改革綱要》，提出了《迎接知識經(jīng)濟時代，建設國家創(chuàng)新體系》、《創(chuàng)新促進發(fā)展，科技引領未來》、《創(chuàng)新２０５０：科學技術與中國的未來》等戰(zhàn)略研究報告。

中國工程院先后開展聯(lián)合培養(yǎng)博士生試點工作，實施了教育部工程科技人才培養(yǎng)研究專項、工程科技人才培養(yǎng)課題研究、舉辦國際工程科技發(fā)展戰(zhàn)略高端論壇等論壇會議。在工程科學技術方面作出重大的、創(chuàng)造性的成就和貢獻，熱愛祖國，學風正派，品行端正。